El IDÆA tiene como objetivo el estudio de los cambios naturales y antropogénicos que ocurren en los ecosistemas mediante técnicas químicas y geoquímicas, fundamentalmente aquellos que suponen incrementos de toxicidad en organismos y humanos. Dispone del Laboratorio de Dioxinas de mayor trayectoria profesional de España y de un parque instrumental en cromatografía y espectrometría de masas que lo sitúan en una posición de liderazgo a nivel europeo.